Nature:全新致癌性机制,相分离驱动异常染色质成环,促进癌症发展

2021-12-13 02:18 来源:汉中妇科医院

帕金森氏症的蓬勃发展与核酸受形体质内在无序区都从(IDR)的DNA间歇开放性密切系统开放性。各种受形体质(包括诱导位点、细胞器调节剂和RNA相结合受形体)中会的IDR通过液-液与此相反(LLPS)逐步形成聚焦可作,负面影响从细胞器逐步形成和刺激耐受到DNA诱导的无数生可作全过程。

所谓的液-液与此相反(LLPS)是称之为糅合两个不系统开放性DNA突变的全过程。该全过程暴发在细胞器内,并必须逐步形成很强各种可作理化学特开放性的都从,这些都从可以促进帕金森氏症,例如急开放性肺炎的暴发蓬勃发展。在急开放性肺炎中会,大分子受形体(NUP98或NUP214)的反复染色形体易位产生了一种间歇开放性糅合形体,它似乎保留大分子受形体 IDR——苯丙氨酸和甘氨酸残基(FG)的串联分散段落基因序列。然而,IDR如何避免DNA错误调控和暴发尚能不清楚。

2021年6同月23日,东卡罗莱纳大学教堂山分校 Gang Greg Wang 小组等 Nature 发表了题为:Phase separation drives aberrant chromatin looping and cancer development 的研究者论文。

该研究者证明与此相反是帕金森氏症逐步形成的涡轮机因素,帕金森氏症通过与此相反赢得突变以成立致癌物质诱导位点聚焦可作,这同时强化了它们的DNA组核酸开放性并在转成全过程中会游离间歇开放性三维空间细胞器结构的逐步形成。该研究者是最早将与此相反与帕金森氏症逐步形成保持联系起来的研究者之一。因为在其他恶开放性中会掩蔽到了相近的DNA糅合,文章中会阐明的程序也可以解释其他类型的帕金森氏症。

NUP98–HOXA9都有两个受形体质基序和一个相结合基因序列。为了研究者NUP98-IDR在肺炎暴发中会的抑制作用,研究者小组主要适用一声除了相结合基因序列的NUP98-HOXA9(N-IDRWT/A9)。

他们发掘出,N-IDRWT/A9对1,6-己二醇(一种用于破坏相-与此相反聚焦形体的甲醛)处理脆弱。纯化的NUP98-IDR(N-IDR)受形体在形体外逐步形成液形体聚焦可作。

为了进一步评估FG段落基因序列对聚焦可作逐步形成的电导率缺少开放性和多价开放性的重要开放性,研究者小组制备了内含不同数量FG段落基因序列的重组N-IDR受形体质。他们发掘出N-IDR都有38个或36个FG以电导率缺少开放性的方式段落逐步形成的液滴,那些都有27个或11个FG的却不能开展与此相反。说明了NUP98–HOXA9中会的IDR以价缺少和电导率缺少的方式成立LLPS。

NUP98–HOXA9通过就是指结构都从与DNA相结合,避免肺炎暴发全过程中会的DNA失调。最后,研究者小组通过细胞器免疫沉淀和高通量高通量来评估IDR内源开放性的与此相反对NUP98–HOXA9细胞器核酸开放性的负面影响。

结果非同示, N-IDRWT/A9很强非同着强化的DNA组占有率,而与无委派聚类表述的峰值亚类无关。此外,宽而密集的;也强化子样峰是N-IDRWT/A9所独有的,并且在发育期和肺炎系统开放性DNA可溶性。

为了进一步评估IDR游离的LLPS在都是由形体细胞器核酸中会的抑制作用,他们利用了病毒学和免疫学的方法,证明IDR内源开放性的LLPS在强化都是由诱导位点核酸开放性方面的因果抑制作用,相比之下;也强化子样峰处看到的那些。说明了IDR强化糅合形体的DNA组相结合并且强化靶DNA诱导。

为了测试者NUP98–HOXA9通过LLPS逐步形成细胞器反转的能力,研究者小组填充了表达N-IDRWT/A9或N-IDRFS/A9细胞的Hi-C图谱,阐明了DNA反转和复制彼此间的高度系统开放性开放性。

为了明确N-IDRWT/A9对Hi-C沾染频率的负面影响,他们挤满了N-IDRWT/A9-和N-IDRFS/A9表达细胞中会500个最反感的N-IDRWT/A9占据位点彼此间的相互抑制作用除此以外。结果非同示,N-IDRWT/A9反转以之外与CTCF无关的方式逐步形成,与与此相反涡轮机程序明确。另外,N-IDRWT/A9特异开放性反转更进一步相连强化子和靶DNA彼此间的相连,支持了糅合诱导位点的IDR通过与此相反在;也强化子样靶标和癌DNA彼此间游离DNA反转的观点。

综上所述,该研究者发掘出NUP98–HOXA9中会内含的LLPS活开放性IDR对肺炎的暴发和致癌物质DNA表达程序的诱导至关重要。这些现像由IDR的能力内源开放性:1)强化诱导位点与DNA组靶标的相结合;2)促进强化子和癌DNA启动子彼此间的慢速反转。

该研究者透过了一个致癌物质突变的数学模型开放性证据,该突变在转成全过程中会促进LLPS涡轮机的诱导位点相结合和3D细胞器重组。由于含IDR的LLPS活开放性分子与广泛的帕金森氏症有关,该研究者阐明的程序也可以解释其他类型的帕金森氏症。

完整出处:

Ahn, J.H., Dis, E.S., Daugird, T.A. et al. Phase separation drives aberrant chromatin looping and cancer development. Nature (2021). https://doi.org/10.1038/s41586-021-03662-5.

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